ลูกแพร์ แอปเปิ้ล ฝรั่ง ควินซ์ พลัม มะยม ส้ม และผลไม้รสเปรี้ยวอื่นๆ มีเพกตินในปริมาณมาก ในขณะที่ผลไม้เนื้ออ่อน เช่น เชอร์รี่ องุ่น และสตรอเบอร์รี่ก็มีเพกตินเป็นเปอร์เซ็นต์
วัสดุทั่วไปของเพคตินในผักและผลไม้สดคือ:
แอปเปิ้ล 1 – 1.5%
แอปริคอท 1%
เชอร์รี่ 0.4%
ส้ม 0.5 – 3.5%
แครอท 1.4%
เปลือกส้ม 30%
ดอกกุหลาบ 15%
วัตถุดิบหลักในการผลิตเพคตินคือเปลือกส้มแห้งหรือกากแอปเปิ้ลซึ่งเป็นผลพลอยได้จากการผลิตน้ำผลไม้ เปอร์เซ็นต์ของกากบีทรูทก็ถูกนำมาใช้เช่นกัน
จากวัสดุเหล่านี้ เพคตินจะถูกกำจัดออกโดยการเติมกรดเจือจางอุ่นที่มีค่า pH ตั้งแต่ 1.5 ถึง 3.5 ในระหว่างการสกัดเป็นเวลาหลายชั่วโมง โปรโตเพคตินจะหลุดสายโซ่สาขาบางส่วนรวมถึงความยาวของสายโซ่ออกและเข้าไปในตัวเลือกด้วย หลังจากการกรอง การกำจัดจะเน้นไปที่เครื่องดูดฝุ่น จากนั้นเอทานอลหรือไอโซโพรพานอลจะรวมอยู่ในเพคตินที่ตกตะกอน เทคโนโลยีเก่าในการตกตะกอนเพคตินด้วยเกลืออะลูมิเนียมไม่ได้ถูกนำมาใช้อีกต่อไป (ยกเว้นแอลกอฮอล์และแคตไอออนหลายวาเลนท์ เพคตินจะเร่งด้วยโปรตีนและสารทำความสะอาดอย่างแน่นอน)
เพคตินเร่งด้วยแอลกอฮอล์ หลังจากนั้นจึงแบ่ง ล้าง และตากให้แห้ง การบำบัดเพกตินเบื้องต้นด้วยกรดอ่อนตัวส่งผลให้เพคตินเอสเทอริฟายต่ำ เมื่อขั้นตอนนี้ประกอบด้วยแอมโมเนียมไฮดรอกไซด์ (NH 3 (aq)) จะได้เพคตินที่มีอะมิเนต หลังจากการอบแห้งและการบด เพกตินมักจะถูกกำหนดมาตรฐานด้วยน้ำตาล ในบางกรณี ด้วยเกลือแคลเซียมหรือกรดอินทรีย์ เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพในการใช้งานเฉพาะอย่าง